sigprocexperts.com Git - dpg/blob - ReadMe.md

   1
   2 # Dual-Polarity GRAPPA (DPG) demo
   3
   4 This collection of Matlab code and data presents one implementation of the method described in
   5 "Dual-Polarity GRAPPA for simultaneous reconstruction and ghost correction of EPI data."
   6 _Magn Reson Med_. 76(1):32-44, Jul 2016.
   7 http://dx.doi.org/10.1002/mrm.25839
   8
   9
  10 ## Data source
  11
  12 EPI gradient-echo BOLD data
  13
  14 - 3T Siemens Trio
  15 - 32 Channel Head coil
  16 - TR 3sec
  17 - TE 30msec
  18 - Echo Spacing 770usec
  19 - 2.0mm isotropic resolution
  20
  21 - 96x60   matrix size
  22 - 192x120 (mm) FOV
  23 - 32 slices, 2mm thick
  24
  25
  26 collected on 2015-05-18, data file MID902
  27
  28 ## Demo Filelist:
  29
  30     data/dpg_acs1.nd     ACS data, with the first readout acquired using RO+
  31     data/dpg_acs2.nd     ACS data, with the first readout acquired using RO-
  32     data/dpg_C.nd        The PLACE ACS image, formed from a combination of dpg_acs1 and dpg_acs2
  33
  34     data/dpg_k.nd        one frame of R=2 EPI data
  35     data/dpg_k_pcref.nd  navigator data for dpg_k, to perform traditional Nyquist ghost correction
  36     data/y.nd            NGC coefficients, derived from dpg_k_pcref and used with phzapply.m
  37     data/y_acs2.nd       NGC coefficients, derived from A and B and used with phzapply.m
  38
  39     dpg_cal.m       the DPG calibration code
  40     dpg_recon.m     the DPG reconstruction code
  41     phzshift.m      calculates the coordinate shift between two k-space data sets using SIEPCM
  42     phzapply.m      a script to apply standard Nyquist ghost correction coefficients
  43     fif.m           a 2D FFT macro script
  44     ifi.m           a 2D FFT macro script
  45     readnd.m        script to read the .nd data files
  46
  47     runthis.m       the main demo script
  48     runthis2.m      an alternate demo script (w/o GESTE/PLACE acs data)
  49